В настоящее время в организационно-методическом отделе используется Информационно-аналитическом отделе используется Информационно-аналитическая система «Канцер-регистр», разработанная Российским центром информационных технологий и эпидемиологических исследований в области онкологии (РЦИТЭО) в составе МНИОИ им. П.А. Герцена, используемая в 20 онкологических диспансерах РФ. Программа позволяет регистрировать и вести учет больных со злокачественными заболеваниями как в территориальном онкологическом учреждении, так и районными онкологами на местах.
Основной задачей отдела является определение приоритетных направлений развития онкологической службы Ставропольского края, совершенствование медицинской помощи пациентам со злокачественными новообразованиями. Организационно-методический отдел занимается оценкой деятельности онкологической службы территорий края, проводит анализ эффективности работы первичного звена здравоохранения, ведет учет активно выявленных пациентов, осуществляет ежемесячный мониторинг и анализ состояния онкологической помощи населению, заболеваемости и смертности населения от онкологических заболеваний, эффективности и качества диагностики, лечения и диспансерного наблюдения за больными с онкологическими заболеваниями, длительности обследования больных с онкологическими заболеваниями и сроков их госпитализации.